Спасибо за совет, еще раз пересмотрел вики с надеждой на этот раз найти решение. На половину нашел). узнал, что настройки по умолчанию (именно клавиатуры и тачпада) находятся в /usr/share/lxqt/session.conf вписал туда необходимые параметры и теперь после обновления, сообщение перестало появляться ...

после обычного обновления sudo pacman -Syu сбрасываются настройки LXQT из-за чего в, последствии, сбрасываются настройки тачпада и раскладки клавиатуры (исчезают сочетания клавиш для смены раскладки и все выбранные языки). В правом нижнем углу появляется сообщение "lxqt-config-monitor применены ...